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Folding at Home: Costa Rica -Pura Vida-

Iniciado por Jorge_Barrientos, junio 26, 2011, 11:14:38 pm

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Jorge_Barrientos

Invito a los ticos a participar en la investigación del Alzheimer, Parkinson y algunos cánceres, de la Universidad de Stanford. Participando en el Equipo Nacional "COSTA RICA - Pura Vida - [email protected] Team: 208154" :)

Jorge_Barrientos

[Instalación] Costa Rica -Pura Vida- folding

Hola muchachos, como están, PURA VIDA.   Yo hoy mejor que ayer.

Aquí les dejo un instructivo (que se ustedes no necesitan mucho) para instalar la versión 7.1.24 de [email protected] Yo estaré visitando esta página para atender cualquier pregunta.
 
 :CR:  
Equipo: Costa Rica - Pura Vida - [email protected]  Código: 208154
 
Antes que todo, [email protected], como software Institucional, y heredero de [email protected] y [email protected], es respetuoso de su privacidad. Se puede pausar, quitar o desinstalar en cualquier momento sin causar el menor daño a tus datos, o a tu computadora, etc.
 
Para descargar [email protected] v 7.1.24, de click en el siguiente enlace:
 
https://fah-web.stanford.edu/projects/FAHClient/wiki/BetaRelease    
 
En la página [email protected] client, seleccione la versión adecuada para su sistema operativo.
Windows XP, Vista, 7 (32 bits):   1: FAHClient v7.1.24 .exe - X86-32 Windows
Windows  Vista, 7 (64 bits):   2: FAHClient v7.1.24 .exe - X86-64 Windows
 
La versión 7.1.24 es profesional, estable, de fácil instalación y administración, la recomiendo. La he usado con Win XP y Win 7, en computadoras viejitas con monoprocesador a 1,2 Ghz a máquinas con 8 procesadores a 3 Ghs.
 
INSTALACIÓN
 
En Windows, se instala simplemente ejecutando el instalador exe que Ud descargó. Siga las instrucciones, deje seleccionado Express install.
 
Se le harán unas preguntas, las importantes son:
Nombre: (digite el nombre bajo que quiere aparezcan sus estadísticas), por ejemplo: Juan_Cambronero. Note que no debe de dejar espacios en blanco en su nombre. Utilice "_" si desea separar dos palabras.
Team: (digite:208154)  Es el número de nuestro Equipo
Passkey:  luego lo analizaremos, déjelo en blanco
Continúe y finalice la instalación.
 
ATENCION IMPORTANTE: Cuando se finaliza la instalación, y el programa quiere comunicarse con la Universidad de Stanford, tu muro cortafuegos (programa que TE PROTEGE en la comunicación en Internet), va a sacar un rótulo de alarma indicando que el programa de [email protected] pretende establecer una comunicación hacia afuera de tu computadora. DALE LA MAYOR AUTORIDAD POSIBLE DE ESTABLECER ESA COMUNICACIÓN. Algunos usuarios no tienen este problema porque su muro cortafuego reconoce a [email protected]
 
Cuando haya terminado la instalación, el programa estará en el directorio de "Archivos de programa\FAHClient" (Win XP); en Win7 "Program Files (x86)\FAHClient" .
 
En su Menú de inicio se incluirá la carpeta "FAHClient", que contiene los elementos instalados.
 
AJUSTES DEL PROGRAMA [email protected]
 
1.  Entra al botón que está arriba a la derecha, a la par de la estrella amarilla que dice "Novice" y selecciona "Expert". Esto te va a dar todas las posibilidades de administrar y visualizar el trabajo que se está realizando.
 
2.  Entra al botón "Preferences". Las cuatro primeras casillas, desde "Start minimized" hasta "Autostart", deben de estar marcadas. Luego "OK"
 
 Busque la cejilla "Status" y click en ella. Normalmente ya está seleccionada. Juegue un rato con los puntitos sombreados, con clic apretado y moviendolos a fin de que dé el tamaño adecuado a las tres ventanitas que tiene la pantalla principal.
 
La primera que es vertical se llama "Clients", en ella se despliega los clientes que Ud está controlando dede esta pantalla. Normalmente solo el cliente local. A la derecha de esa ventanita, hay dos ventanitas horizontales. La superior llamada "Folding Slots", indica que procesamientos se están llevando a cabo; en este momemto tendrá un renglón que dice "smp : x", donde x es el número de procesadores que están trabajando. Al lado de "smp : x" el rótulo indica el estado que se encuentra, ahora o dentro de un rato dirá "Running" en verde.
 
En la ventanita inferior llamada "Work Queue" indica el número de la cola de paquetes que está utilizando. En este momento estará en "01 Running" en verde. En resumen, esto indica que en la computadora local, se está corriendo el smp en el procesador central, y utilizando la cola 01. La información que Ud ve alrededor, trata de las características de ese paquete de datos. Si lo desea, estudielos es interesante. Si no le interesa, continuemos.
 
3. Ahora click en el botón "CONFIGURE"
 
3.1  "Connection". Normalmente esto no es relevante. Es útil para quien tiene varias computadoras trabajando y quiere monitorear los programas desde una sola de ellas. Si es su caso, consúlteme y ampliaré este aspecto.
 
3.2  "Identity". Esta pestaña es importante porque lo identifica a Ud, ante [email protected], y la llave que protege su comunicación con la U de Stanford.
 
     a)  Revise que "Name" esté como Ud lo desea. Por ejemplo "Juan_Cambronero"
 
     b)  El "Team Number" debe de ser "208154", que es el número de identificación de nuestro Equipo.
 
     c)  "Passkey". Presiona "Click here to open the open [email protected] passkey request Web page". Al presionarlo, se te harán un par de preguntas. "Donorname:" de nuevo digite su nombre ejemplo "Juan_Cambronero"; en "Email Address:" digite su dirección de correo electrónico completo, por ejemplo: "[email protected]". Después de corroborar que los datos son los correctos, click en "Get Passkey".
 
Vaya a su correo electrónico, [email protected] le enviará un email con un código mmuuuyy largo. Guárdalo muy bien, ojala con tus datos importantes en una llave maya. Ese código es el que te identifica y protege en la comunicación con [email protected] Para manejar ese código lo mejor es marcar-copiar-pegar.
 
     Con el código copiado, pégelo en Passkey y Reenter. Con "Valid" en verde, apriete el botón "Save". Al apretar "SAVE". Volverá a la pantalla principal.
 
3.3 De nuevo vamos al botón Configure, ahora a la cejilla "Slots". El programa al instalarse detecta el procesador (CPU) que tiene su computadora y configura adecuadamente el slots (0  smp).
 
 El segundo slots que se puede adicionar, es con respecto al procesamiento en la tarjeta de video llamada GPU (Grafic Procesing Unit). Las tarjetas de video actuales son muy potentes. Tanto así que muy fácilmente superan al CPU.
(Si Ud utiliza el video integrado de su computadora, no tiene esta opción habrá finalizado la instalación. Continue dos párrafos abajo)
 
En fin, para poner a trabajar la GPU, estando en la cejilla "Slots", aprete el botón "Add", marque con un click en "GPU ID" y luego "OK" y luego Save. Y listo. Si su tarjeta de video puede hacerlo lo hará.
 
De regreso en la pantalla principal, aprete la cejilla "Log". Se le mostrará la lista de acciones que está haciendo la computadora.  En esa lista dirá si el procesamiento con la GPU, se está iniciando y llevando a cabo o si NO puede procesar con el GPU.
 
Después de ver el listado, click en la cejilla "Status", en las dos ventanitas horizontales, que Usted había dimensionado, en la ventanita superior "Folding slot", presione el renglón de gpu 0, verá que en la ventanita inferior"Work Queue" se oscurece un renglón e indica si está trabajando o no. Si en las dos ventanitas se indica "Running", es que la gpu 0, está trabajando. Dele dos minutos para pueda terminar la instalación de los programas de trabajo de la GPU. Si pasados dos minutos no indican "Running" mejor desactive el trabajo en el GPU. Para esto ingrese de nuevo en Configure, cejilla Slots, click en el renglón de 1 gpu, click en "Remove", luego en "Save". NO SE PREOCUPE NADA DE ESTO DAÑARÁ LA COMPUTADORA. Si la GPU no pudo trabajar, comuníquese conmigo, y yo le ayudaré a ver si es posible que se pueda procesar con su tarjeta de video.
 
Otras opciones de Configure
4. "Remote Access". Esta cejilla se utiliza para monitorear el trabajo de una segunda computadora, desde la central. Si se da el caso consúlteme.
5. "Proxy". Trata de empresas o viviendas donde tienen una computadora destinada a concentrar y dirigir el tráfico de internet.
6. "Advanced" Lo siguiente es para las personas que quieren administrar afinar el programa más, sobre todo cuando se trata de una NOTEBOOK.
6.1 Percent CPU usage. Esto le indica al programa hasta cuanto del procesamiento de procesador principal, está autorizado a utilizar. Sobre todo en las Notebook es recomendable bajarlo a 80 o 75%, usted lo va midiendo sobre todo en cuanto a su calentamiento. Recuerde una Notebook NO debe de usarse sentada sobre una mesa, busque un par de palitos adecuados para que uno en cada extremo, le permita al aire circular por debajo de ella, lo anterior como regla mínima. Esto le ayuda en el control de la temperatura.
6.2 Checkpointing frequency. El programa graba en el disco los resultados cada cierto tiempo, y forma un último punto de arranque, por si la computadora se apagara o se quitara el proma. Es una cuestión de confianza, 10 o 15 cualquiera es bueno.
6.3 Optimization. Se debe de utilizar cuando se requieran ciertos atributos en la administración del programa. El primero trata de no utilizar la optimización del código, sobre todo para procesadores muy viejos. La segunda cuando es necesario ligar el trabajo a un hilo o CPU específico. En general es mi experiencia de que no hay ninguna necesidad de este ligado. El Sistema Operativo maneja tan bién un programa de tan baja prioridad que no da el menor problema en el desempeño del computador.
6.4 Power. Con las Notebook, click en el cuadrito. Esto evita que el programa trabaje cuando la computadora se encuentra solo con baterias.
6.5 Verbosity. Trata de la cantidad de información que va a desplegar en la cejila "Log". Cuando ocurre algún tipo de problemas y se desea tener buena documentación  al respecto se sube Verbpsoty a 5. 3 es un nivel medio bueno. 1 cuando se tiene mucha confianza y no se desea estar consultando, excepto el % de avance en el procesamiento del paquete. 0 No despliega nada en Log.
 
7."Expert" déjelas como están. Podría ir ampliando este aspecto si alguien tiene interés.
8. Por último, aprete "Save". Y listo, vuelve a la pantalla principal.
 
Antes de continuar, aprete la cejilla "Sistem Info". En la parte intermedia verá características de su tarjeta de video. Si Ud no tiene muchos conocimientos de computadoras, mejor comuniquese a travez de la página de comunidad para ayudarle, buscar la información de su tarjeta de video y aconsejarle, con respecto al GPU (Gráfico Procesamiento Unidad)
 
El programa que debe activar es FAHControl. El Acceso Directo tiene que estar en " Inicio" en su Menú su menú de Programas; así cuando usted ingrese a su escritorio automáticamente se iniciará el folding. Este programa trabaja a un nivel de prioridad tan baja que usted no notará ninguna disminución en el desempeño de su máquina.
 
Recuerde al final no aprete el botón X (derecha arriba), esto desactiva (CIERRA) el programa, en lugar de ello aprete "Hide" para que el programa se reduzca a la barra de trabajo.
 
En caso de que desactivaras el programa apretando la "X" (a mi me ha pasado), lo que debe de hacer es ir al menú de programas y en la carpeta "Inicio" estará FAHControl, click y se iniciará de nuevo. Muy poco se ha perdido. El programa respalda su trabajo cada 10 minutos.
 
En cualquier momento puede apretar "Save" y en otro momento continuar revisando la configuración. Si tiene dudas consúlteme, estoy para servirle.
 
Por ultimo en la pantalla principal, en la cejilla "LOG", el programa va haciendo un historial de su trabajo. Revisalo si quieres, es emocionante monitoriar como se avanza.
 
TRES PUNTOS DE ACCESO A ESTADÍSTICAS.
 
Estando en la pantalla principal, click en el nombre que pusiste. Se despliega en el navegador de Internet, una página que poco a poco vas a ir visitando con frecuencia. La otra estadística es del equipo y también personal, click en "Team" sobre el número 208154. Observa que a la par el botón señala [email protected], sin embargo hay tres enfoques más. A mi (que soy Estadístico) la que juzgo de mejor calidad y actualización es KAKAO STATS. Si quieres velas todas, son gustos.
 
 
ALGUNOS PENSAMIENTOS SOBRE EL PROCESAMIENTO.
 
Todo depende, de cuanta importancia le des a tu colaboración en la investigación.
 
Puedes usar la computadora normalmente y apagarla cuando te plazca.
 
Desde esa posición, al OTRO EXTREMO, estoy yo. Te cuento lo que yo hago. NO uso salvapantallas, el monitor se apaga a los 3 minutos de no uso. Esto para evitar que la computadora deba de estar gastando tiempo en mantener la pantalla y gastando más electricidad.
En cualquier caso, yo apago el monitor si me voy a ausentar un rato. Por otra parte YO TENGO TRABAJANDO LA COMPUTADORA 24 horas al día, siete días a la semana (24/7). Realmente, no he notado variaciones importantes en la cuenta de electricidad. Cuando la voy a usar que es con mucha frecuencia, prendo el monitor y muevo el ratón, en un momento está a mi servicio.
 
 
PARA GANAR PUNTOS BONIFICACIÓN EN LOS PUNTOS PROCESADOS POR EL CPU
 
Las normas son: haber entregado procesadas 10 unidades de trabajo (WU) o más en el procesador principal (CPU). Con las siguientes condiciones:
 
1. Que se hayan echado a perder un máximo del 20% de los paquetes de trabajo WU que se recibieron (echar a perder casi nunca ocurre)
 
2. Que el procesamiento se haya hecho utilizando la identificación completa. Esto se refiere al "Passkey", que se le envió por email.
 
Listo. Los paquetes que procese en la CPU contarán.
 
La bonificación depende de varios factores: los puntos del paquete (WU), y el tiempo en que se retorne procesado. Entre más rápido, más puntos. Esto depende del poder del procesador (CPU). Para un paquete de 100 puntos, un CPU lento ganará de 100 a 160, mientras un CPU muy rápido podrá llegar a obtener hasta 250 puntos.
 
Para los paquetes (WU) procesados en las GPU (procesador de la tarjeta gráfica), no hay bonificaciones, por ahora. Está en estudio el plan para integrarlos a la bonidicación por rápido tiempo de entrega, similar a los paquetes del CPU
 
----------------------------------------
Descarga general. NO es mi experiencia, pero por costumbre mundial, debo indicar que NO soy responsable de ningún daño, rotura, golpe, torcedura, quebradura, perdida, robo, sobre-voltaje, calentamiento, incendio, explosión, o cualquier otro percance en su equipo. TODO lo expuesto en esta página, usted está en posición de aceptarlo, discutirlo, rechazarlo etc. ES SU DECISIÓN.
V2.1.3

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Legamos a los 400 mil puntos y vamos rápido para los 500 mil. Cada Tico que se une hace más fuerte el equipo.

JorgeAVM

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Yo eventualmente pongo algún equipo en el trabajo, quizá más de uno.
Un día de estos me pongo a eso, Dios mediante.

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Noticias de [email protected]  Por: Director Vijay Pande

(JUNIO-JULIO 2011)
1)Un cambio que está en desarrollo para  dar a todos paquetes de trabajo clásicos de la GPU, el bono por retorno rápido, igual que se otorgan al CPU. Esto ayudaría a tener más equilibrio entre los proyectos de [email protected]
2)En la versión 7.1.25, próxima a salir
   * Se ha añadido algunas nuevas tarjetas Radeon HD 6xxx.
   * Se ha añadido Nvidia GTX 590 ID de dispositivo 0x1088.
   * Aumentar la Radeon HD 5xxxx y 6xxxx nivel de GPU por uno.

3)En la versión 7.1.26, en desarrollo, se ha añadido apoyo al GPU de AMD Radeon HD 6600

(MARZO 2011)
Se liberó  el Núcleo 16 de ATI.

Estoy feliz de anunciar, que con el lanzamiento de la versión 7.1.24  en beta abierta, se da apoyo a los paquetes de trabajo en el GPU ATI con el núcleo 16 GPU3,con métodos avanzados de [email protected]

Hay algunas limitaciones en nuestra capacidad para apoyar a tarjetas ATI. En particular, estamos apoyando a los que tienen  OpenCL 1.1 con el fin de obtener el mejor rendimiento de los equipos.
Esto significa que sólo los GPU de las tarjetas ATI 5xxx o superiores trabajarán con el nuevo núcleo de 16 (la serie 3xxx no son compatibles y la serie 4xxx no tiene soporte de OpenCL suficiente).
Sin embargo, vamos a continuar el desarrollo del núcleo 11 y a esperar al menos hasta el 01 de septiembre 2011 con el fin de apoyar el hardware más viejo.

Recuerden actualizar, los drivers de sus tarjetas de video. Es esencial para el mejor desempeño de ellas (NT).

Además, estamos trabajando para mejorar  el desempeño de los  GPUs NVIDIA  últimamente salidos al mercado, con estructura FERMI, un pazo más adelante del CUDA.

Estamos muy contentos de poder dar soporte OpenCL para GPU de ATI.

 (Traducción,  recopilación y resumen : Jorge Barrientos)    :blah:
Fuente:  http://folding.typepad.com/news/

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Hola, me han pedido que aclare de que se trata [email protected] (en tico).
 
     Lo que se estudia es como se forman las proteínas en el cuerpo humano, al formarse mal dan el alzhéimer, párkinson y algunos cánceres. Hay muchos factores que afectan, aceleran, y propician esta mala formación de las proteínas. Los factores son muchos, alcalinidad, temperatura, % de agua, urea, tiempo, y otros muchos más.

     Además se investiga que modelos Matemáticos- Estadísticos pueden describir mejor esa formación de las proteínas. El problema es largo. La Universidad de Stanford, ya ha obtenido muchos resultados concretos en el avance de la investigación Sin embargo falta mucho y las partes más importantes están por descubrirse en el futuro.  

     Para esto son necesarios recursos computacionales inmensos. Solo trabajando conjuntamente millones de computadoras unidas por internet, podremos descubrir como se forman mal las proteínas y producen el alzhéimer y el párkinson, por ejemplo. Para esto uno instala en su compu un programa que ayuda en la investigación, sin afectar el trabajo normal.

     Cuando el programa se instala y se pone trabajar, el solo se comunica con la U de Stanford por internet, baja un paquetito de datos y se pone a procesar esos datos. Cuando el programa termina de trabajar con un paquete de datos, envía los resultados a la U, baja otro paquete de datos y comienza de nuevo.

     Este procesamiento de datos, lo hace no solo con el procesador principal, también usa la capacidad de las tarjetas de video. Las tarjetas de video actuales, son poderosas. Todas las marcas se han superado a lo largo de los años, en forma increíble; ATI,  NVIDIA, AMD, RADEON y otras, hacen tarjetas que llegan a tener algunos miles de procesadores en una sola tarjeta de video.

     La Universidad de Stanford, es una de las cinco más prestigiosas del mundo. Esto nos garantiza que no va a exponer su prestigio mundial, haciendo cosas indebidas en nuestras computadoras. Como me han sugerido algunas mentes sencillas, que es para robarnos la información de nuestras computadoras; poner virus; vigilar lo que uno hace; etc.

     La seguridad informática, que es otra preocupación, tiene su historia. [email protected], es el heredero de [email protected] y de [email protected], y como tal, su seguridad como red mundial se ha venido incrementando cada vez más a lo largo de más de dos décadas.

     Esta red de computadoras, que integramos todos nosotros, está clasificada como la SUPER COMPUTADORA DE PROCESAMIENTO DISTRIBUIDO MAS PODEROSA DEL MUNDO, variando entre 5 a 7 petaflows nativos (10-12 petaflows x86)

[/hr]
Referencias:
1.-http://en.wikipedia.org/wiki/[email protected]
2.-http://folding.stanford.edu/
3.-http://es.wikipedia.org/wiki/[email protected]

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

COSTA RICA - Pura Vida - [email protected] Team: 208154
Llegamos a 500 Mil puntos 23/07/2011
Nuevos miembros del Equipo; BIENVENIDOS!!! : FOROdelPC y JorgeAVM

Estadísticas: http://fah-web.stanford.edu/cgi-bin/main.py?qtype=teampage&teamnum=208154

Guest

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Ummm me gusta, 100 k en seis dias. Antes yo procesaba como anonimo con la v6. Me cae bien el asunto de estar en un grupo, nadie me vinea de cuanto hago poquitto o mucho, pero ayudo en algo. voy a estudiar el asunto y poner a llevarme la v7 que este mae recomienta. pero eso si en el grupo FOROdelPC, me cae bien.

JorgeAVM

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Tuanis!
Bienvenido :okas:

Yo estoy re-comenzando en este mundillo, ya había participado brevemente en una competición, pero ahora quisiera integrarme de forma permanente. Tengo 2 maquinitas ya funcionando, no son la gran cosa pero están 24/7 :PV:

Que se cuide Jorge Barrientos, porque voy a destronarlo de ese primer lugar xD

koda

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

entonces las GPU no puntuan nada?

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Una aclaración.
Las GPU si cuentan los puntos y algunas veces mas que el CPU.  
La diferencia ahora, es que la GPU, no tiene bonificación.
Están estudiando la necesidad de equiparar el beneficio de las bonificaciones para el GPU y darles el mismo tratamiento que las CPU.

Recuerden que la bonificación para el CPU, se da después de tener 10 unidades procesadas, eso si con el Passkey de firma personal.    

Me encantaría que me pasaran adelante, claro que daré pelea.  Saludes a todos.  ;)

koda

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

ok ya mas claro le haré a gusto XD

Jorge_Barrientos

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

Lo que es dificil imaginarse una máquina con 8  procesadores, overclocleada tanto en el CPU (XEON) como en e GPU gtx 260 con drivers nuevos con los procesadores shader trabajando a 1250 mgrs,  que para mantega bien la temperatura, le compre un ventilador de 12 pulgadas que (la compu sin tapa) trabaja 24/7. Parece cuando en el aeropuerto una antes podia estacionarse detras de donde salen los aviones. (exajero)

JorgeAVM

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

jajaja sí hace buen ruidito.

Guest

Re:Compitamos como país, Costa Rica -Pura Vida- folding

el decir del mae de la bandera, esta bien. yo tendo un monton de paquetiticos procesados. mi carcacha no tiene bonificacion porque duro tanto que nada, solo me hago 60 y resto de puntos por paquetito. Si alguien quiere usar mi paskey pidamelo yo se lo envio su buzon privado en foro. con eso pueden procesar con el procesador principal y les dan bonos. segun se el nombre pude ser cualquiera, yo he cambiado de nombre en de las estadística como 4 veces, siempre funciona igual. Me lo piden yo se lo mando por correo del foro. OK maes nos vemos. en la noche paso a ver si alguien quiere. sino hasta mañana en la tarde o la noche.

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